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靶向代谢组学(Targeted Metabolomics)介绍

靶向代谢组学是一种聚焦特定代谢物的高灵敏度、高精准度的分析方法,通过针对性地检测已知代谢物的浓度变化,揭示生物体内代谢通路的功能状态。广泛应用于疾病机制研究、药物开发、营养学及精准医学等领域。


一、技术原理

靶向代谢组学基于质谱(MS)或核磁共振(NMR)技术,通过以下步骤实现:

  1. 代谢物提取:从生物样本(血清、尿液、组织等)中提取目标代谢物。

  2. 分离与检测

    • 液相色谱-质谱联用(LC-MS/MS):高灵敏度、高特异性,适合小分子代谢物(如氨基酸、脂质)。

    • 气相色谱-质谱联用(GC-MS):适用于挥发性代谢物(如有机酸、糖类)。

    • NMR:非破坏性检测,适合复杂样本(如体液)。

  3. 定量分析:通过内标法(同位素标记或结构类似物)精准定量目标代谢物浓度。


二、核心特点

特点 说明
高灵敏度 可检测低至飞摩尔(fmol)级别的代谢物。
高特异性 通过多反应监测(MRM)排除干扰,精准识别目标代谢物。
绝对定量 基于标准曲线和内标,提供浓度数据(如μM/mg蛋白)。
覆盖通路明确 聚焦特定代谢通路(如TCA循环、脂代谢、氨基酸代谢)。

三、常见分析目标

1. 能量代谢相关

  • 糖酵解/糖异生:葡萄糖、乳酸、丙酮酸。

  • TCA循环:柠檬酸、α-酮戊二酸、琥珀酸。

  • 氧化磷酸化:ATP、ADP、NADH。

2. 脂质代谢

  • 脂肪酸:棕榈酸、油酸。

  • 磷脂:PC、PE、PS。

  • 鞘脂类:神经酰胺、鞘氨醇。

3. 氨基酸与核苷酸

  • 必需氨基酸:亮氨酸、缬氨酸。

  • 神经递质前体:谷氨酸、GABA。

  • 嘌呤/嘧啶:AMP、UMP。

4. 氧化应激与信号分子

  • 活性氧(ROS):谷胱甘肽(GSH/GSSG)。

  • 一碳代谢:S-腺苷甲硫氨酸(SAM)、同型半胱氨酸。


四、应用场景

1. 疾病机制研究

  • 癌症:Warburg效应(乳酸堆积)与肿瘤微环境。

  • 心血管疾病:心肌缺血中TCA循环代谢紊乱。

  • 神经退行性疾病:帕金森病中多巴胺代谢异常。

2. 生物标志物发现

  • 糖尿病:血液中支链氨基酸(BCAAs)水平升高。

  • 肝损伤:胆汁酸谱异常。

3. 药物开发与毒性评估

  • 药效评价:他汀类药物对胆固醇合成的抑制效果。

  • 毒性机制:药物诱导的线粒体功能损伤(ATP下降)。

4. 营养与运动科学

  • 膳食干预:Omega-3脂肪酸对血脂谱的影响。

  • 运动代谢:运动后乳酸/丙酮酸动态变化。


五、实验流程

 

关键步骤说明

  1. 样本前处理:避免反复冻融,使用甲醇/乙腈沉淀蛋白。

  2. 仪器参数

    • LC-MS:电喷雾离子化(ESI±),MRM模式优化碰撞能量。

    • GC-MS:衍生化(如BSTFA)提高挥发性。

  3. 质量控制(QC):插入混合样本QC监控批次效应。


六、数据分析

1. 常用软件与数据库

  • 分析工具:Skyline(MRM数据处理)、MetaboAnalyst(统计分析)。

  • 数据库:HMDB、KEGG、METLIN。

2. 统计方法

  • 多元分析:PCA、PLS-DA(区分组间差异)。

  • 单变量分析:T检验/ANOVA(筛选显著差异代谢物)。

  • 通路分析:KEGG通路映射(如“丙氨酸代谢”)。


七、与非靶向代谢组学的对比

参数 靶向代谢组学 非靶向代谢组学
目标 已知代谢物绝对定量 全局代谢物筛查(未知物发现)
灵敏度 更高(飞摩尔级) 较低(微摩尔级)
通量 低(数十至数百种代谢物) 高(数千种代谢物)
应用场景 机制验证、临床标志物 初步筛查、新代谢物发现

八、案例展示

  • 案例1:通过靶向检测琥珀酸水平,揭示其在高血压患者血浆中的积累与血管炎症的关系(Circulation Research)。

  • 案例2:LC-MS/MS定量肿瘤患者谷氨酰胺代谢,指导IDH抑制剂个性化治疗。


九、总结

靶向代谢组学凭借高精准定量的优势,是研究特定代谢通路、验证生物标志物的黄金标准。适用于:

  • 机制研究:锁定关键代谢物与通路。

  • 转化医学:开发临床诊断Panel。

  • 精准干预:指导营养或药物治疗策略。

技术选择建议

  • 若需发现新代谢物→ 先非靶向筛查,再靶向验证。

  • 若需精准定量已知代谢物→ 直接靶向检测(如LC-MS/MS MRM)。

 

高效液相
编号 项目名称 种类
1 植物激素类 16种
2 有机酸类 12种
3 脂溶性维生素类 5种
4 水溶性维生素类 7种
5 生物胺类 6种
6 氨基酸 18种
7 皂苷类 6种
8 抗生素类 5种
9 植物色素类 9种
10 黄酮多酚类 9种
11 腺苷类 4种
12 对羟基苯甲酸酯类 4种
13 吲哚类 4种
LC-MS/MS靶向代谢组
编号 项目名称 种类
1 植物激素类 31种
2 氮代谢类 14种
3 脂肪酸代谢类 12种
4 有机酸检测 15种
5 抗生素检测 18种
6 氨基酸及其衍生物 56种
7 胆汁酸检测 25种
8 脂肪酸检测 32种
9 维生素检测 23种
10 神经递质检测 4种
11 核苷酸检测 18种
GC-MS/MS靶向代谢组
编号 项目名称 种类
1 有机酸检测 8种
2 脂肪酸甲酯类 37种
3 挥发性醇类 6种
4 VFA类 6种
ICP-MS  
 
编号 项目名称  
1 微量元素检测  
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