靶向代谢组学(Targeted Metabolomics)介绍
靶向代谢组学是一种聚焦特定代谢物的高灵敏度、高精准度的分析方法,通过针对性地检测已知代谢物的浓度变化,揭示生物体内代谢通路的功能状态。广泛应用于疾病机制研究、药物开发、营养学及精准医学等领域。
一、技术原理
靶向代谢组学基于质谱(MS)或核磁共振(NMR)技术,通过以下步骤实现:
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代谢物提取:从生物样本(血清、尿液、组织等)中提取目标代谢物。
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分离与检测:
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液相色谱-质谱联用(LC-MS/MS):高灵敏度、高特异性,适合小分子代谢物(如氨基酸、脂质)。
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气相色谱-质谱联用(GC-MS):适用于挥发性代谢物(如有机酸、糖类)。
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NMR:非破坏性检测,适合复杂样本(如体液)。
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定量分析:通过内标法(同位素标记或结构类似物)精准定量目标代谢物浓度。
二、核心特点
特点 | 说明 |
---|---|
高灵敏度 | 可检测低至飞摩尔(fmol)级别的代谢物。 |
高特异性 | 通过多反应监测(MRM)排除干扰,精准识别目标代谢物。 |
绝对定量 | 基于标准曲线和内标,提供浓度数据(如μM/mg蛋白)。 |
覆盖通路明确 | 聚焦特定代谢通路(如TCA循环、脂代谢、氨基酸代谢)。 |
三、常见分析目标
1. 能量代谢相关
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糖酵解/糖异生:葡萄糖、乳酸、丙酮酸。
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TCA循环:柠檬酸、α-酮戊二酸、琥珀酸。
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氧化磷酸化:ATP、ADP、NADH。
2. 脂质代谢
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脂肪酸:棕榈酸、油酸。
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磷脂:PC、PE、PS。
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鞘脂类:神经酰胺、鞘氨醇。
3. 氨基酸与核苷酸
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必需氨基酸:亮氨酸、缬氨酸。
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神经递质前体:谷氨酸、GABA。
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嘌呤/嘧啶:AMP、UMP。
4. 氧化应激与信号分子
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活性氧(ROS):谷胱甘肽(GSH/GSSG)。
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一碳代谢:S-腺苷甲硫氨酸(SAM)、同型半胱氨酸。
四、应用场景
1. 疾病机制研究
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癌症:Warburg效应(乳酸堆积)与肿瘤微环境。
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心血管疾病:心肌缺血中TCA循环代谢紊乱。
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神经退行性疾病:帕金森病中多巴胺代谢异常。
2. 生物标志物发现
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糖尿病:血液中支链氨基酸(BCAAs)水平升高。
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肝损伤:胆汁酸谱异常。
3. 药物开发与毒性评估
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药效评价:他汀类药物对胆固醇合成的抑制效果。
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毒性机制:药物诱导的线粒体功能损伤(ATP下降)。
4. 营养与运动科学
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膳食干预:Omega-3脂肪酸对血脂谱的影响。
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运动代谢:运动后乳酸/丙酮酸动态变化。
五、实验流程
关键步骤说明:
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样本前处理:避免反复冻融,使用甲醇/乙腈沉淀蛋白。
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仪器参数:
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LC-MS:电喷雾离子化(ESI±),MRM模式优化碰撞能量。
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GC-MS:衍生化(如BSTFA)提高挥发性。
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质量控制(QC):插入混合样本QC监控批次效应。
六、数据分析
1. 常用软件与数据库
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分析工具:Skyline(MRM数据处理)、MetaboAnalyst(统计分析)。
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数据库:HMDB、KEGG、METLIN。
2. 统计方法
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多元分析:PCA、PLS-DA(区分组间差异)。
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单变量分析:T检验/ANOVA(筛选显著差异代谢物)。
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通路分析:KEGG通路映射(如“丙氨酸代谢”)。
七、与非靶向代谢组学的对比
参数 | 靶向代谢组学 | 非靶向代谢组学 |
---|---|---|
目标 | 已知代谢物绝对定量 | 全局代谢物筛查(未知物发现) |
灵敏度 | 更高(飞摩尔级) | 较低(微摩尔级) |
通量 | 低(数十至数百种代谢物) | 高(数千种代谢物) |
应用场景 | 机制验证、临床标志物 | 初步筛查、新代谢物发现 |
八、案例展示
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案例1:通过靶向检测琥珀酸水平,揭示其在高血压患者血浆中的积累与血管炎症的关系(Circulation Research)。
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案例2:LC-MS/MS定量肿瘤患者谷氨酰胺代谢,指导IDH抑制剂个性化治疗。
九、总结
靶向代谢组学凭借高精准定量的优势,是研究特定代谢通路、验证生物标志物的黄金标准。适用于:
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机制研究:锁定关键代谢物与通路。
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转化医学:开发临床诊断Panel。
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精准干预:指导营养或药物治疗策略。
技术选择建议:
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若需发现新代谢物→ 先非靶向筛查,再靶向验证。
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若需精准定量已知代谢物→ 直接靶向检测(如LC-MS/MS MRM)。
高效液相 | ||
编号 | 项目名称 | 种类 |
1 | 植物激素类 | 16种 |
2 | 有机酸类 | 12种 |
3 | 脂溶性维生素类 | 5种 |
4 | 水溶性维生素类 | 7种 |
5 | 生物胺类 | 6种 |
6 | 氨基酸 | 18种 |
7 | 皂苷类 | 6种 |
8 | 抗生素类 | 5种 |
9 | 植物色素类 | 9种 |
10 | 黄酮多酚类 | 9种 |
11 | 腺苷类 | 4种 |
12 | 对羟基苯甲酸酯类 | 4种 |
13 | 吲哚类 | 4种 |
LC-MS/MS靶向代谢组 | ||
编号 | 项目名称 | 种类 |
1 | 植物激素类 | 31种 |
2 | 氮代谢类 | 14种 |
3 | 脂肪酸代谢类 | 12种 |
4 | 有机酸检测 | 15种 |
5 | 抗生素检测 | 18种 |
6 | 氨基酸及其衍生物 | 56种 |
7 | 胆汁酸检测 | 25种 |
8 | 脂肪酸检测 | 32种 |
9 | 维生素检测 | 23种 |
10 | 神经递质检测 | 4种 |
11 | 核苷酸检测 | 18种 |
GC-MS/MS靶向代谢组 | ||
编号 | 项目名称 | 种类 |
1 | 有机酸检测 | 8种 |
2 | 脂肪酸甲酯类 | 37种 |
3 | 挥发性醇类 | 6种 |
4 | VFA类 | 6种 |
ICP-MS | ||
编号 | 项目名称 | |
1 | 微量元素检测 |